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[解決済み] エラー: gdal がインストールされているのに、R 依存パッケージのインストール中に gdal-config が見つからない

2022-02-05 05:27:46

質問

不足している点をご指摘ください。

openSUSE 11.3


xx@linux-y3pi:~/Desktop/R> sudo R CMD INSTALL rgdal_0.7-12.tar.gz 
root's password:
* installing to library ‘/usr/lib64/R/library’
* installing *source* package ‘rgdal’ ...
** package ‘rgdal’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: gdal-config: gdal-config
checking gdal-config usability... ./configure: line 1353: gdal-config: command not found
no
Error: gdal-config not found
The gdal-config script distributed with GDAL could not be found.
If you have not installed the GDAL libraries, you can
download the source from  http://www.gdal.org/
If you have installed the GDAL libraries, then make sure that
gdal-config is in your path. Try typing gdal-config at a
shell prompt and see if it runs. If not, use:
 --configure-args='--with-gdal-config=/usr/local/bin/gdal-config'
with appropriate values for your installation.

ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’
* removing ‘/usr/lib64/R/library/rgdal’


xx@linux-y3pi:~/Desktop/R> whereis gdal-config
gdal-config: /usr/local/bin/gdal-config

xx@linux-y3pi:~/Desktop/R> gdal-config 
Usage: gdal-config [OPTIONS]
Options:
 [--prefix[=DIR]]
 [--libs]
 [--dep-libs]
 [--cflags]
 [--datadir]
 [--version]
 [--ogr-enabled]
 [--formats]
 xx@linux-y3pi:~/Desktop/R>


> sessionInfo()
R version 2.15.1 (2012-06-22)
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=C                 LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
> 


xx@linux-y3pi:~/Desktop/R> gdal-config --version
1.9.0

xx@linux-y3pi:~/Desktop/R> proj
Rel. 4.8.0, 6 March 2012
usage: proj [ -beEfiIlormsStTvVwW [args] ] [ +opts[=arg] ] [ files ]


linux-y3pi:~ # $PATH
bash: /home/xx/qtsdk-2010.05/qt/bin/:/home/xx/qtsdk-2010.05/bin:/home/xx/qtsdk-2010.05/qt/bin:/home/xx/qtsdk-2010.05/qt/bin/:/home/xx/qtsdk-2010.05/bin:/usr/lib64/mpi/gcc/openmpi/bin:/home/xx/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/sbin:/usr/sbin:/bin:/usr/bin/X11:/usr/X11R6/bin:/usr/games: No such file or directory

解決方法は?

を使用する必要があります。 -dev のヘッダーと共有ライブラリのリンクが含まれるパッケージです。 開発 の通常のパッケージの他に デプロイメント . ディストロに関する限り、2つの異なる使用例があります。

私のディストリビューションでは

edd@max:/tmp$ dpkg -l | grep gdal | cut -c-72
ii  libgdal1-1.7.0                                1.7.3-6ubuntu3        
ii  libgdal1-dev                                  1.7.3-6ubuntu3        
edd@max:/tmp$ 

R CMD INSTALL rgdal_0.7-8.tar.gz は、CRAN でのビルド時のすべてのチェックを考えると、CRAN パッケージから期待されるように、うまく動作します。

2016年末にアップデート。 コメントで@JoshO'Brienさんが指摘されているように

<ブロッククオート

マイナーアップデート:ここでは2016年、Ubuntu 14.04.2が動作しています。 libgdal1h のようです。 が libgdal1 (ただし libgdal1-dev はまだ必要です)。少なくとも を実行しようとすると、そのような趣旨のエラーが発生します。 apt-get install libgdal1

Ubuntu 16.04の場合、対応する行は次のようになります。
sudo apt-get install libgdal1i

このような上流ライブラリのリネームはよくあることで、次のようなものです。 apt-cache search libgdal は、現在のパッケージ名を特定するのに役立ちます。 また 重要 しかし、quot;abstract" 開発パッケージの libgdal-dev は、"concrete" 現在のランタイムパッケージを引っ張ってくるので、ビルドに必要なのはそれだけです(ここでは。 libgdal1i ) を依存関係を通じて取り込みます。