jinja2.exceptionsでTemplateNotFoundエラーが発生しました。

このエラーは、テンプレートフォルダの配置ミスです。テンプレートフォルダは、アプリケーションが実行されているフォルダに配置されるべきで、つまり、テンプレートフォルダがランタイムファイルと同じ階層にあることを意味します。